一、黄河上游特有鱼类国家级水产资源保护区

黄河上游特有鱼类国家级水产种质资源保护区于2007年12月12日由农业部以第947号公告批准建立。保护区总面积为13289公顷，其中核心区7501公顷，试验区5788公顷。核心区特别保护期为4-8月。保护区位于甘肃、四川、青海省境内黄河干流及其支流黑河、白河、泽曲河部分河段，范围在东经100°48′34″-103°09′55″,北纬33°11′14″-34°54′13″之间。黄河干流部分从甘肃省玛曲县阿孜扣哈入河口（101°53′50″E,33°31′00″N）起，向东经玛曲县齐哈玛畅隆（齐哈玛吊桥），向北经玛曲县的河曲马场，再折向西经玛曲县欧拉乡安茂村、青海省河南县多送乡河口，至宁木特乡（100°48′34″E，34°41′35″N）止，全长471.5公里。支流白河从四川省若尔盖县的唐克乡一大队（102°35′24″E，33°11′14″N）至白河入黄河口处（102°27′07″E，33°28′07″N），长41公里。支流黑河从四川若尔盖县包座牧场（103°09′55″E，33°28′01″N），向东经嫩哇乡政府至黑河入黄河口处（102°08′17″E，33°58′16″N），长352公里。支流泽曲河从青海省河南县的苏孚迪日山（101°37′13″E,34°54′13″N）,向南经河南县宁木特乡宁木塔村至宁木特乡入黄河河口处（101°08′22″E，34°29′04″N），长135公里。其中，核心区4段：第一段从畅隆（101°55′55″E，33°26′45″N）到桑盖通瓦若（102°02′10″E，33°57′35″N）；第二段从黑河入黄河口（102°08′17″E，33°58′16″N）到嫩哇乡政府（102°36′50″E，33°51′36″N）；第三段从西科河入河口（101°13′54″E，34°17′50″N）到额玛河入河口（101°03′19″E,34°30′47″N）;第四段从泽曲河入河口（101°08′22″E,34°29′04″N）到宁木塔村（101°20′09″E，34°35′28″N）。试验区6段，位于保护区核心区以外的河段。保护区主要保护拟鲶高原鳅、厚唇重唇鱼、扁咽齿鱼、花斑裸鲤、黄河裸裂尻鱼、骨唇黄河鱼和黄河高原鳅的产卵场、索饵场和越冬场。

二、平通河裂腹鱼类国家级水产种质资源保护区

平通河裂腹鱼类国家级水产种质资源保护区于2014年11月25日由农业部以第2181号公告批准建立。保护区总面积1918.9公顷，其中核心区面积1139.4公顷，实验区面积779.5公顷。保护区特别保护期为全年。保护区位于四川省平武县、北川县、江油市境内的平通河干流及支流平南河，范围在东经104°19′08″-104°43′40″，北纬31°43′17〞- 32°10′55〞之间,包括平通河干流平武县宽坝林场-豆叩镇-平通镇新元村-北川县桂溪镇-江油市大康镇大康大桥-彰明镇班竹园涪江汇合口，支流平南河平武县平南乡-平通镇新元村，全长160km。其中核心区长95 km，分为二段：第一段为平通河源头平武县宽坝林场(104°19′08″E、 32°10′55″N )-豆叩镇(104°35′31″E、 32°06′28″N )，长54km，面积647.7公顷；第二段为平通河平武县平通镇新元村(104°40′06″E、 32°05′11″N )-江油市大康镇大康大桥(104°43′40″E、 31°51′36″N )，长41km，面积491.7公顷。实验区长65 km，分为三段：第一段为平通河平武县豆叩镇(104°35′31″E、 32°06′28″N )-平通镇新元村(104°40′06″E、 32°05′11″N )，长10km，面积119.9公顷；第二段为支流平南河平武县平南乡 (104°38′13″E、 32°10′45″N )-平通镇新元村(104°40′06″E、 32°05′11″N )，长30km，面积359.8公顷；第三段为平通河江油市大康镇大康大桥(104°43′40″E、 31°51′36″N )-彰明镇班竹园涪江汇合口(104°42′22″E、 31°43′17″N )，长25km，面积299.8公顷。主要保护对象为重口裂腹鱼、中华裂腹鱼、细痣疣螈、大鲵、青石爬鮡、黄石爬鮡、刺鲃，其它保护物种包括鳖、壮体鮡、前臀鮡、华鲮、大鳍鳠、黄颡鱼、鲤、鲫、鳜等。该保护区为我省少有的同时分布有珍稀水生野生动物和水生经济物种的水产种质资源保护区，保护价值重要。

三、郪江黄颡鱼国家级水产种质资源保护区

郪江黄颡鱼国家级水产种质资源保护区于2008年10月22日由农业部以第1130号公告批准建立。保护区总面积520公顷，其中核心区面积400公顷,实验区面积120公顷。核心区特别保护期为全年。保护区位于四川省遂宁市大英县的郪江江段，四川盆地东中部腹心地带，范围在东经105°10′01"—105°26′41"，北纬30°37′36"—32°42′30"之间，全长65公里，从起点到终点依次经过：象山镇—蓬莱镇—隆盛镇—回马镇。核心区位于郪江象山镇凤阳村—蓬莱镇火井村和隆盛镇黄腊溪村—郪江末端（回马镇双江社区），范围在东经105°10′01"—105°12′31"，北纬30°27′16"—32°42′30"之间和东经105°18′01"—105°26′41"，北纬30°37′36"—32°12′10"之间，长50公里。实验区位于蓬莱镇火井村—隆盛镇黄腊溪村，范围在东经105°12′31"—105°18′01"，北纬30°27′16"—32°12′10"之间，长15公里。主要保护对象为黄颡鱼、鳜鱼、中华鳖，栖息的其他物种有大口鲶、乌鳢、鲫鱼等。

四、渠江黄颡鱼白甲鱼国家级水产种质资源保护区

渠江黄颡鱼白甲鱼国家级水产种质资源保护区于2008年10月22日由农业部以第1130号公告批准建立。保护区总面积1299.3公顷,其中核心区面积383.8公顷,实验区面积915.5公顷。核心区特别保护期为全年。保护区全长65公里，位于四川省广安市广安区、前锋区境内，范围在东经106°32′—107°03′和北纬30°18′—30°50′之间。其中核心区位于肖溪镇南溪村—白马乡洪江村，长19.2公里。实验区位于肖溪镇勤劳村—肖溪镇南溪村（实验区第一段）和白马乡洪江村—大龙乡光华村（实验区第二段），全长45.8公里。主要保护对象为黄颡鱼、白甲鱼，栖息的其他物种包括长薄鳅、大鳍鱯、长春鳊、岩原鲤、中华倒刺鲃、南方大口鲶、鳜鱼、细鳞斜颌鲴、华鲮、翘嘴红鲌、乌鳢、鲤、鲫等。

五、嘉陵江岩原鲤中华倒刺鲃国家级水产种质资源保护区

嘉陵江岩原鲤中华倒刺鲃国家级水产种质资源保护区于2008年10月22日由农业部以第1130号公告批准建立。保护区总面积1400公倾，其中核心区面积600公顷，实验区面积800公顷。核心区特别保护期为全年。保护区位于四川省广安市武胜县境内的嘉陵江秀观音至下观音沟段，全长35公里，范围在东经105°20′—106°16′，北纬30°15′—30°21′之间，其东岸是：旧县—中心—真静—铜鼓沱，西岸是：中心—清平—南溪—下观音。核心区位于青滩嘴至何家溪段，长15公里，范围在东经105°47′15″—106°12′35″，北纬30°17′59″—30°20′19″之间。实验区分为两段，第一段位于秀观音至青滩嘴段，长15公里，范围在东经105°20′05″—105°47′15″，北纬30°15′07″—30°17′59″之间；第二段位于何家溪段至下观音沟段，长5公里，范围在东经106°12′35″—106°16′00，北纬30°20′19″—30°20′59″之间。主要保护对象为岩原鲤、中华倒刺鲃，其他保护物种包括胭脂鱼、白甲鱼、大口鲶、黄颡鱼、鲤等。

六、梓江国家级水产种质资源保护区

梓江国家级水产种质资源保护区于2009年12月17日由农业部以第1308号公告批准建立。保护区总面积800公顷，其中核心区面积420公顷，实验区面积380公顷。特别保护期为全年。保护区地处四川省绵阳市盐亭县的梓江河段，范围在东经105°12′50″—105°19′10″，北纬31°15′50″—31°25′18″之间。保护区流经安家镇安家小河子-毛公乡章邦大桥-两河镇新民村，全长55km。其中安家小河子-章邦大桥为核心区，长38 km，核心区范围为10个拐点沿河道方向顺次连线所围的水域，拐点坐标分别为安家镇安乐村（105°14′30"E，31°25′18"N）—安家镇裕荣村（105°12′50"E，31°22′4"N）—柏梓镇川石村（105°15′10"E，31°19′54"N）—柏梓镇镇江村（105°16′8"E，31°19′35"N）—柏梓镇麟亭村（105°17′25"E，31°18′18"N）—柏梓镇石船村（105°14′5"E，31°18′48"N）—毛公乡觉灵村（105°17′15"E，31°16′56"N）—毛公乡群乐村（105°17′58"E，31°15′36"N）—毛公乡高渠村（105°15′15"E，31°15′14"N）—毛公乡石宝村（105°18′10"E，31°14′54"N）；章邦大桥—两河新民村为实验区，长17 公里，实验区范围为6个拐点沿河道方向顺次连线所围的水域，拐点坐标分别为毛公乡解放村（105°18′45"E，31°15′10"N）—两河镇高团村（105°18′5"E，31°18′27"N）—两河镇五一村（105°12′57"E，31°17′20"N）—两河镇林场村（105°17′5"E，31°12′10"N）—两河镇白虎村（105°18′3"E，31°12′18"N）—两河镇新民村（105°19′10"E，31°11′50"N）。主要保护对象为鳜、黄颡鱼、中华倒刺鲃，其它保护对象包括翘嘴鲌、乌鳢、细鳞斜颌鲴、鲤、鲫等。

七、仪陇河特有鱼类国家级水产种质资源保护区

仪陇河特有鱼类国家级水产种质资源保护区于2009年12月17日由农业部以第1308号公告批准建立。保护区总面积977公顷，其中核心区面积587公顷，实验区面积390公顷。特别保护期为全年。保护区位于四川省仪陇县仪陇河铜鼓乡严家村五社桥、五福镇笋店村桥至双胜镇钟鸣村龙岗河桥之间。范围在东经106°24′40"—106°26′07"，北纬31°19′40"—31°25′47"之间。保护区河流全长51公里。核心区为赛金镇潮水坝村桥（106°24′40"E、31°23′05"N）至双胜镇钟鸣村龙岗河桥（106°26′07"E、31°19′40"N），长28公里。其东岸是铜鼓乡五通嘴村，五福镇黄家村、笋壳店村，赛金镇雷家坝村、芝兰坝村、灯台山村、干坝子村、龙背梁村、潮水坝村，双胜镇王家庄村、玉龙村、白鹤村、龙王庙村、金狮村；西岸是铜鼓乡严家桥村、常家营村、响滩子村、金锅场村，赛金镇五佛寺村、高家坝村、杨二坝村、石梁子村，双胜镇新民村、火红村、黄连坝村、任家庵村、竞赛村、钟鸣村。实验区为铜鼓乡严家村五社桥（106°25′25"E、31°25′47"N）、五福镇笋店村桥（106°24′50"E、31°24′58"N）至赛金镇潮水坝村桥（106°24′40"E、31°23′05"N），长23公里。主要保护对象为中华鳖、乌龟，其他保护对象为南方大口鲶、鳜、黄颡鱼、乌鳢、鲤、鲫等。

八、濛溪河特有鱼类国家级水产种质资源保护区

濛溪河特有鱼类国家级水产种质资源保护区于2009年12月17日由农业部以第1308号公告批准建立。保护区总面积232公顷，其中核心区面积168公顷，实验区面积64公顷。特别保护期为全年。保护区地处四川省资中县沱江主要支流濛溪河，河流全长37公里，范围在东经104°27′—105°07′，北纬29°34′—30°24′之间，由大濛溪河从双龙镇黄潭井与小濛溪河从龙江镇清泉洞向下游至双龙镇两河口汇合，再至濛溪河苏家湾镇章渔箭。核心区河流位于大濛溪河至濛溪河，长21公里，是由以下9个拐点沿河道方向顺次连线所围的水域：双龙镇黄潭井（104°55′16.8″E， 29°52′56.7″N），双龙镇田家沟（104°55′44.6″E，29°53′17.8″N），双龙镇柏树湾（104°55′59.2″E，29°53′09.7″N），马鞍镇樊家湾（104°56′31.8″E，29°52′43.8″N），马鞍镇谷堂湾（104°57′20.1″E， 29°52′16.2″N），马鞍镇何家坳（104°57′18.7″E，29°50′12.9″N），双龙镇两河口（104°56′50.7″E，29°49′38.4″N），狮子镇岩沟滩（104°57′30.1″E，29°48′06.5″N），苏家湾镇章渔箭（104°57′11.3″E， 29°47′40.5″N）；实验区河流位于小濛溪河，长16公里，是由以下5个拐点沿河道方向顺次连线所围的水域：龙江镇清泉洞（104°59′35.7″E，29°51′50.2″N），马鞍镇麻柳滩（104°59′24.4″E， 29°51′12.9″N），马鞍镇龙洞庵（104°58′37.5″E，29°50′08.2″N），狮子镇老沉沱（104°57′39.4″E，29°49′20.4″N），双龙镇两河口（104°56′50.7″E，29°49′38.4″N）。主要保护对象是南方大口鲶，其它保护对象包括鳜、鲫、黄颡鱼、中华鳖、中华倒刺鲃等。

九、通河特有鱼类国家级水产种质资源保护区

通河特有鱼类国家级水产种质资源保护区于2010年11月25日由农业部以第1491号公告批准建立。保护区总面积1970公顷，其中核心区面积945公顷，实验区面积1025公顷。特别保护期为全年。保护区位于四川省平昌县境内，属渠江水系的通河，范围在东经107°06′26″—107°15′04″，北纬31°33′50″—31°40′30″之间。保护区是经上游至下游的澌滩乡凉亭村断滩（107°15′04″E，31°40′30″N）、澌滩乡泥滩子（107°13′43″E，31°39′41″N）、云台镇洗滩坝（107°12′52″E，31°36′21″N）、元山镇浮跃子（107°09′51″E，31°38′24″N）、江口镇荔枝码头（107°08′56″E，31°33′50″N）、江口镇石桥沟（107°08′56″E，31°33′50″N）、江口镇王家嘴码头（107°06′26″E，31°33′50″N）七个拐点的通河组成，包括通河流经的澌滩乡凉亭村断滩—澌滩乡泥滩子—云台镇洗滩坝—元山镇浮跃子—江口镇荔枝码头—江口镇石桥沟—江口镇王家嘴码头，全长43.8km。其中核心区为：云台镇云台码头（107°11′29″E，31°38′35″N）—江口镇荔枝码头（107°08′56″E，31°33′50″N），长21 km。实验区分为2段，即澌滩乡凉亭村断滩（107°15′04″E，31°40′30″N）—云台镇云台码头（107°11′29″E，31°38′35″N），长18.8 km；江口镇荔枝码头（107°08′56″E，31°33′50″N）—江口镇王家嘴码头（107°06′26″E，31°33′50″N），长4 km。主要保护对象为中华倒刺鲃、华鲮，其他保护对象包括岩原鲤、翘嘴红鲌、黄颡鱼、鳜、白甲鱼等。

十、嘉陵江南部段国家级水产种质资源保护区

嘉陵江南部段国家级水产种质资源保护区于2010年11月25日由农业部以第1491号公告批准建立。保护区总面积5996公顷，其中核心区面积1999公顷，实验区面积3997公顷。特别保护期为全年。保护区位于四川省南部县境内嘉陵江段，范围在东经106°00′—106°12′、北纬31°16′—31°23′之间，是自上游至下游经由老鸦镇文家坝村（106°01′E，31°23′N）、老鸦镇（106°00′E，31°23′N）、盘龙镇（106°07′E，31°16′N）、石河镇四合村（106°12′E，31°18′N）四个拐点的嘉陵江段。上游以老鸦镇文家坝村为界，下游以石河镇四合村与仪陇县交界处为界，跨老鸦镇、火峰乡、河东镇、南隆镇、谢河镇、盘龙镇、碾盘乡、楠木镇、石河镇九个乡镇，全长60公里。其中核心区为南隆镇新华村（106°05′E，31°20′N）至碾盘乡红寺村（106°11′E，31°19′N）的嘉陵江段，长20km。实验区分为2段，第一段为老鸦镇文家坝村（106°01′E，31°23′N）至南隆镇新华村（106°05′E，31°20′N），长30km；第二段为碾盘乡红寺村（106°11′E，31°19′N）至石河镇四合村（106°12′E，31°18′N），长10km。主要保护对象为中华倒刺鲃、黄颡鱼、南方大口鲶、四川白甲鱼，其他保护对象包括胭脂鱼、岩原鲤、中华鳖、乌龟、鲤、鲫、鳜、长薄鳅、鮦鱼等。

十一、构溪河特有鱼类国家级水产种质资源保护区

构溪河特有鱼类国家级水产种质资源保护区于2010年11月25日由农业部以第1491号公告批准建立。保护区总面积1420公顷，其中核心区面积850公顷，实验区面积570公顷。特别保护期为全年。保护区位于四川省阆中市境内，属嘉陵江支流构溪河，范围在东经105°40′59″—106°28′35″，北纬31°21′51″—31°50′54″之间。自上游至下游依次经由龙泉镇与苍溪县交界处龙泉场（106°24′32″E，31°50′54″N）、千佛镇千佛河（106°28′35″E，31°46′37″N）、扶农乡罗家沱（106°10′25″E，31°34′54″N）、河溪镇河家坝（105°40′59″E，31°21′51″N）四个拐点的构溪河组成，全长79公里。其中核心区为石滩镇石滩场（106°15′26″E，31°42′20″N）经扶农乡罗家沱（106°10′25″E，31°34′54″N）至河溪镇河家坝（105°40′59″E，31°21′51″N）的河段，长45公里。实验区为龙泉镇龙泉场（106°24′32″E，31°50′54″N）经千佛镇千佛河（106°28′35″E，31°46′37″N）至石滩镇石滩场（106°15′26″E，31°42′20″N）的河段，长34公里。主要保护对象为中华倒刺鲃、四川白甲鱼、中华鳖、鳜、南方大口鲶、黄颡鱼，其他保护对象包括鲤、鲫、乌龟、黄鳝、泥鳅等。

十二、龙潭河特有鱼类国家级水产种质资源保护区

龙潭河特有鱼类国家级水产种质资源保护区于2010年11月25日由农业部以第1491号公告批准建立。保护区总面积701公顷，其中核心区面积184公顷，实验区面积517公顷。特别保护期为全年。保护区位于四川省万源市境内，属渠江水系的中河，在万源市境内称为龙潭河，全长61公里，范围在东经108°05′9.7″—108°19′51.7″，北纬31°44′24.1″—31°54′34″之间。保护区是自上游至下游依次经由堰塘乡高家河坝（108°19′51.7″E，31°54′24.3″N）、堰塘乡张公坝（108°19′20″E，31°54′34″N）、堰塘乡干坝子河（108°18′19.1″E，31°54′17.8″N）、旧院镇青龙咀（108°12′46″E，31°51′26.7″N）、井溪乡杉树梁（108°17′20″E，31°47′32″N）、井溪乡柳树坝（108°14′35.5″E，31°45′46″N）、固军乡水车坝（108°05′9.7″E，31°44′24.1″N）七个拐点的龙潭河及支流组成。其中核心区为从堰塘乡高家河坝（108°19′51.7″E，31°54′24.3″N）经旧院镇走马坝至旧院镇四平村（108°15′0″E，31°49′2.6″N）的龙潭河干流，长16公里。实验区分为四段，第一段是从旧院镇四平村（108°15′0″E，31°49′2.6″N）至固军乡水车坝（108°05′9.7″E，31°44′24.1″N）的龙潭河干流，长20公里；第二段是从井溪乡杉树梁（108°17′20″E，31°47′32″N）至四平村入龙潭河口（108°15′0″E，31°49′2.6″N）的刘家坝河，长8公里；第三段是从井溪乡柳树坝（108°14′35.5″E，31°45′46″N）至新场入龙潭河口（108°12′23.8″E，31°47′13.7″N）的井溪河，长5公里；第四段是从旧院镇青龙咀（108°12′46″E，31°51′26.7″N）至桅杆岭入龙潭河口（108°07′46″E，31°47′26.7″N）的旧院河，长12公里。主要保护对象为中华裂腹鱼、重口裂腹鱼、中华纹胸鮡、白缘央、黑尾央、大鲵，其它保护对象包括中华鳖、中华倒刺鲃、南方大口鲶、鳜鱼、大鳍鱯等。